MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 88035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019753	AAC	2	6	77	82	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303694
2	NC_019753	AAC	2	6	164	169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303694
3	NC_019753	ATA	2	6	173	178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303694
4	NC_019753	TAC	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303694
5	NC_019753	GTA	2	6	256	261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303694
6	NC_019753	GGA	2	6	307	312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303694
7	NC_019753	TAC	2	6	324	329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303694
8	NC_019753	T	6	6	428	433	0 %	100 %	0 %	0 %	428303694
9	NC_019753	TGT	2	6	441	446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303694
10	NC_019753	TAA	2	6	453	458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303694
11	NC_019753	TGC	2	6	471	476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303694
12	NC_019753	TGGCAG	2	12	482	493	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428303694
13	NC_019753	GCAA	2	8	564	571	50 %	0 %	25 %	25 %	428303694
14	NC_019753	GCT	2	6	652	657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303694
15	NC_019753	AGC	2	6	699	704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303694
16	NC_019753	TAG	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303694
17	NC_019753	AAGGA	2	10	740	749	60 %	0 %	40 %	0 %	428303694
18	NC_019753	CCT	2	6	829	834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303694
19	NC_019753	AGA	2	6	938	943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303694
20	NC_019753	GTGAT	2	10	974	983	20 %	40 %	40 %	0 %	428303694
21	NC_019753	AT	3	6	987	992	50 %	50 %	0 %	0 %	428303694
22	NC_019753	CTA	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303694
23	NC_019753	ATTA	2	8	1035	1042	50 %	50 %	0 %	0 %	428303694
24	NC_019753	AT	3	6	1053	1058	50 %	50 %	0 %	0 %	428303694
25	NC_019753	CAA	2	6	1112	1117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303694
26	NC_019753	TAC	2	6	1314	1319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303694
27	NC_019753	AGTT	2	8	1391	1398	25 %	50 %	25 %	0 %	428303694
28	NC_019753	CAG	2	6	1839	1844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303695
29	NC_019753	GCG	2	6	1893	1898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303695
30	NC_019753	GA	3	6	1972	1977	50 %	0 %	50 %	0 %	428303695
31	NC_019753	GAT	2	6	1986	1991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303695
32	NC_019753	CTTCTG	2	12	2020	2031	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428303695
33	NC_019753	AGA	2	6	2060	2065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303695
34	NC_019753	GTA	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303695
35	NC_019753	AATT	2	8	2102	2109	50 %	50 %	0 %	0 %	428303695
36	NC_019753	GTT	2	6	2147	2152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303695
37	NC_019753	TGA	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303695
38	NC_019753	TGC	2	6	2228	2233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303695
39	NC_019753	GTT	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303695
40	NC_019753	ACT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303695
41	NC_019753	GAA	2	6	2292	2297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303695
42	NC_019753	GAA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303695
43	NC_019753	AAGT	2	8	2386	2393	50 %	25 %	25 %	0 %	428303695
44	NC_019753	TA	3	6	2407	2412	50 %	50 %	0 %	0 %	428303695
45	NC_019753	AGT	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303695
46	NC_019753	GAC	2	6	2539	2544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303695
47	NC_019753	ATT	2	6	2546	2551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303695
48	NC_019753	AGA	2	6	2587	2592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303695
49	NC_019753	GATA	2	8	2612	2619	50 %	25 %	25 %	0 %	428303695
50	NC_019753	CAG	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303695
51	NC_019753	ATA	2	6	2704	2709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303695
52	NC_019753	ATGG	2	8	2739	2746	25 %	25 %	50 %	0 %	428303695
53	NC_019753	CTG	2	6	2761	2766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303695
54	NC_019753	TGGG	2	8	2821	2828	0 %	25 %	75 %	0 %	428303695
55	NC_019753	AAT	2	6	3460	3465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303696
56	NC_019753	TCAA	2	8	3698	3705	50 %	25 %	0 %	25 %	428303696
57	NC_019753	TTAA	2	8	3742	3749	50 %	50 %	0 %	0 %	428303696
58	NC_019753	ATA	2	6	3875	3880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303696
59	NC_019753	TAA	3	9	3938	3946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303696
60	NC_019753	ATT	2	6	4003	4008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303696
61	NC_019753	GAT	2	6	4021	4026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303696
62	NC_019753	GAACTC	2	12	4034	4045	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428303696
63	NC_019753	TTA	2	6	4084	4089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303696
64	NC_019753	AAGC	2	8	4111	4118	50 %	0 %	25 %	25 %	428303696
65	NC_019753	ATCA	2	8	4216	4223	50 %	25 %	0 %	25 %	428303696
66	NC_019753	TCT	2	6	4261	4266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303696
67	NC_019753	A	6	6	4268	4273	100 %	0 %	0 %	0 %	428303696
68	NC_019753	ATT	2	6	4303	4308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303696
69	NC_019753	ATT	2	6	4378	4383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303696
70	NC_019753	CAA	2	6	4423	4428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303696
71	NC_019753	T	6	6	4502	4507	0 %	100 %	0 %	0 %	428303696
72	NC_019753	ATT	2	6	4552	4557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303696
73	NC_019753	A	7	7	4603	4609	100 %	0 %	0 %	0 %	428303696
74	NC_019753	TTTA	2	8	4616	4623	25 %	75 %	0 %	0 %	428303696
75	NC_019753	GTT	2	6	4628	4633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303696
76	NC_019753	GTT	2	6	4673	4678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303696
77	NC_019753	GTT	2	6	4691	4696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303696
78	NC_019753	T	6	6	4755	4760	0 %	100 %	0 %	0 %	428303696
79	NC_019753	GAT	2	6	4761	4766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303696
80	NC_019753	A	7	7	4786	4792	100 %	0 %	0 %	0 %	428303696
81	NC_019753	TGAA	2	8	4803	4810	50 %	25 %	25 %	0 %	428303696
82	NC_019753	CTT	2	6	7277	7282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303697
83	NC_019753	ATGG	2	8	7327	7334	25 %	25 %	50 %	0 %	428303697
84	NC_019753	CAT	2	6	7343	7348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303697
85	NC_019753	CAT	2	6	7367	7372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303697
86	NC_019753	AAT	2	6	8898	8903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303698
87	NC_019753	CATC	2	8	8907	8914	25 %	25 %	0 %	50 %	428303698
88	NC_019753	GAT	2	6	8970	8975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303698
89	NC_019753	TCA	2	6	8996	9001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303698
90	NC_019753	ATT	2	6	9067	9072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303698
91	NC_019753	ACC	2	6	9080	9085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303698
92	NC_019753	AGT	2	6	9091	9096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303698
93	NC_019753	TAA	2	6	9104	9109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303698
94	NC_019753	GCAG	2	8	9161	9168	25 %	0 %	50 %	25 %	428303698
95	NC_019753	CA	3	6	9171	9176	50 %	0 %	0 %	50 %	428303698
96	NC_019753	A	6	6	9186	9191	100 %	0 %	0 %	0 %	428303698
97	NC_019753	TTTC	2	8	9198	9205	0 %	75 %	0 %	25 %	428303698
98	NC_019753	TTC	2	6	9235	9240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303698
99	NC_019753	TTCC	2	8	9259	9266	0 %	50 %	0 %	50 %	428303698
100	NC_019753	CTT	2	6	9291	9296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303698
101	NC_019753	AAT	2	6	9301	9306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303698
102	NC_019753	CTA	2	6	9315	9320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303698
103	NC_019753	TAAG	2	8	9349	9356	50 %	25 %	25 %	0 %	428303698
104	NC_019753	TAT	2	6	9426	9431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303698
105	NC_019753	TTG	2	6	9460	9465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303698
106	NC_019753	TTA	2	6	9497	9502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303698
107	NC_019753	A	7	7	9529	9535	100 %	0 %	0 %	0 %	428303698
108	NC_019753	CAA	2	6	9540	9545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303698
109	NC_019753	CGC	2	6	9590	9595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303698
110	NC_019753	ACTT	2	8	9607	9614	25 %	50 %	0 %	25 %	428303698
111	NC_019753	ATA	2	6	9662	9667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303698
112	NC_019753	TCA	2	6	9686	9691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303698
113	NC_019753	GCG	2	6	9992	9997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303698
114	NC_019753	ATTAAG	2	12	10034	10045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428303698
115	NC_019753	ACTC	2	8	10192	10199	25 %	25 %	0 %	50 %	428303699
116	NC_019753	TAA	2	6	10315	10320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303699
117	NC_019753	ATTG	2	8	10324	10331	25 %	50 %	25 %	0 %	428303699
118	NC_019753	TTA	2	6	10374	10379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303699
119	NC_019753	AAT	2	6	10466	10471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303699
120	NC_019753	CAT	2	6	10663	10668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303700
121	NC_019753	CTT	2	6	10671	10676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303700
122	NC_019753	ATTG	2	8	10770	10777	25 %	50 %	25 %	0 %	428303700
123	NC_019753	CG	3	6	10817	10822	0 %	0 %	50 %	50 %	428303700
124	NC_019753	CAT	2	6	10827	10832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303700
125	NC_019753	CT	3	6	10853	10858	0 %	50 %	0 %	50 %	428303700
126	NC_019753	C	6	6	10875	10880	0 %	0 %	0 %	100 %	428303700
127	NC_019753	TGA	2	6	10892	10897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303700
128	NC_019753	ATC	2	6	10921	10926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303700
129	NC_019753	CTT	2	6	10965	10970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303700
130	NC_019753	ATT	2	6	10988	10993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303700
131	NC_019753	ATC	2	6	11011	11016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303700
132	NC_019753	AGC	2	6	11021	11026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303700
133	NC_019753	CTC	2	6	11047	11052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303700
134	NC_019753	TTC	2	6	11122	11127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303700
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247	NC_019753	AT	3	6	18318	18323	50 %	50 %	0 %	0 %	428303704
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261	NC_019753	ATGTGG	2	12	19113	19124	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428303705
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263	NC_019753	TAA	2	6	19213	19218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303705
264	NC_019753	GCA	2	6	19223	19228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303705
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266	NC_019753	TAAT	2	8	19317	19324	50 %	50 %	0 %	0 %	428303705
267	NC_019753	GGC	2	6	19357	19362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303705
268	NC_019753	GCA	2	6	19385	19390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303705
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280	NC_019753	GCC	2	6	20370	20375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303707
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282	NC_019753	TTA	2	6	20460	20465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303707
283	NC_019753	TAGTG	2	10	20477	20486	20 %	40 %	40 %	0 %	428303707
284	NC_019753	TATT	2	8	20665	20672	25 %	75 %	0 %	0 %	428303707
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290	NC_019753	TAC	2	6	20975	20980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303707
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292	NC_019753	TA	3	6	21049	21054	50 %	50 %	0 %	0 %	428303707
293	NC_019753	AT	3	6	21102	21107	50 %	50 %	0 %	0 %	428303707
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372	NC_019753	T	6	6	26173	26178	0 %	100 %	0 %	0 %	428303711
373	NC_019753	CAA	2	6	26211	26216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303711
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